Mélissa Garry

Dynamique des hot-spots de bactéries ferro-oxydantes

Directeurs de thèse :Tanguy Le Borgne, Hervé Tabuteau et Alexis Dufresne

Résumé : Les bactéries ferro-oxydantes sont abondantes dans les aquifères de socle fracturés et plus particulièrement dans un aquifère du massif Armoricain (Bretagne, France). Ces bactéries se localisent dans les interfaces de mélange entre des eaux récentes (riches en oxygène et pauvres en minéraux dissous) et anciennes (pauvres en oxygène et riches en minéraux dissous). Il s’agit ainsi d’environnements caractérisés par de forts gradients chimiques, ne correspondant pas aux conditions homogènes classiquement utilisées en laboratoire. L’objectif de cette thèse est de comprendre la dynamique des bactéries ferro-oxydantes en explorant la diversité et l’écologie des Gallionellaceae au sein du milieu souterrain et ainsi de mieux comprendre le fonctionnement biogéochimique global de ce milieu. Une approche pluridisciplinaire, faisant intervenir des analyses métagénomiques/transcriptomiques et hydrogéochimiques, a été privilégiée pour répondre à cet objectif.

Participe à l'ERC Reactive Fronts et à l'ANR IRONSTONE